顺应潮流:仅血浆ctDNA-MRD检测的领域前景!

2022-01-24 04:43:52 来源:
分享:

"酪氨酸被纳入MRD探测的创造力是指明的,期盼这些进展将在此期间提颇高世代MRD探测的病态能。"

癌症的MRD探测是一种锐利且特异的故近似于风险评估癌症症状血清里面源病态遗传物质(如ctDNA)相对总数的方法有。在这种状态下,症状没有肉眼可见的结核,但确实依赖于新标准诊断图像方法有无法探测到但最终可能会引致癌症中风的微小结核。

MRD,故常特指微小残存结核(Minimal Residual Disease)。运用于“Minimal” (微小)这个用法,是因为它在古书和诊断科学家里面更加故近似于。不过,“Minimal”这个用法确实不具“误导病态”,因为低电子技术水平的病因在生存率和疗法执行者多方面也确实不具重要意义。“Measurable”(可精确测量)一用法可更加准确地描述残存在病人体内的癌细胞的依赖于。NCCN简介同时运用于了“Minimal Residual Disease”(微小残存结核)和“Measurable Residual Disease”(可精确测量残存结核)两个术语。

此外,可行病态研究课题表明在分子电子技术水平上探测多种癌症类型的ctDNA同样不具诊断好处,古书和诊断科学家有时也可能会运用于“Molecular Residual Disease”(分子残存结核)一用法。

近年来,国内外在并不一定里面基于ctDNA的MRD检验(ctDNA-MRD)的诊断数据资料和确凿证据越来越多,带进了并不一定腺MRD探测的热潮。并不一定腺ctDNA-MRD探测的电子技术流派主要有两大类:

1)Tumor-informed assays(知情归纳)

对原发的组织展开核酸以鉴定症状的特异线粒体变异图谱,然后建筑设计亚硫酸盐定制panel或运用于固定panel展开个病态化的ctDNA探测归纳。

2)Tumor-uninformed assays(不知情归纳)

也可以特指Tumor-agnostic assays或Tumor-naïve assays,即无均需原发的组织,大部分依赖于一个大预先选定亚硫酸盐/电极建筑设计的与癌症类型之外的固定panel展开ctDNA探测归纳,故常在探测ctDNA等位基因突变的同时,辅以ctDNA酪氨酸或片段组学等都能学方法有。弥补了的组织比对严重不足或风险评估位点严重不足或TAT耽误等问题。

Tumor-informed assays的电子技术策略更加符合社可能会大众的感知,在保证颇高特异病态的也就是说下,可通过风险评估多位点的sample-level(比对电子技术水平)颇颇高其孔径,电子技术如此一来相对来说不是特别颇高。Tumor-uninformed assays的电子技术策略更加类似年从前筛,通过提颇高site-level(位点电子技术水平)探测孔径并辅以ctDNA酪氨酸或片段组学并联结神经网络算法颇颇高其孔径和特异病态,电子技术如此一来相对来说极颇高。

2021年4月29日,《Clinical Cancer Research》在线发表了“大部分运用于白蛋白ctDNA探测结膀胱癌症状微小残存结核(MRD)”的文章,首次公开了Guardant Reveal的研究课题数据资料:MRD探测孔径逾到91%,特异病态逾100%,这些发现拥护了大部分白蛋白ctDNA-MRD探测(Tumor-uninformed assays)的潜在诊断用到。

2021年8月13日,《Clinical Cancer Research》在线发表了“顺应潮流:大部分白蛋白ctDNA-MRD探测的用到从前景”的文章,在这里研究课题者们咨询检验了大部分白蛋白ctDNA探测MRD的能力,以及将酪氨酸整合到ctDNA探测的潜在用处。2

Parikh及其同僚1 和Taieb及其同僚3 咨询了大部分白蛋白ctDNA-MRD探测在结膀胱癌(CRC)症状里面的潜在诊断用到。

▲ ctDNA酪氨酸和等位基因突变在两项研究课题里面的用到尤其(Parikh和Taieb)

结膀胱癌(CRC)的疗法仅仅面临着一个下一场,即相当多的CRC症状因年从前期疾病中风而过年从前死亡。尽管诊断使用了新标准的基本功能疗法,但颇高风险IIIC期CRC症状的5年准确率也大部分有53%,究其原因是没有发现具体方法上未探测到的微小残存结核(MRD)。4

现在,仍迫切均无需准确明确哪些症状术后依赖于MRD,以帮助范本缩减或增大基本功能疗法,并增大医治的确实病态,同时尽量地缩减可避免疗法的之外毒病态。

在过去的几年里,我们对ctDNA在CRC诊断和生存率里面的用到有了相当多的了解。现在,基于ctDNA的MRD检验正相当多应故近似于癌症的疗法里面。

ctDNA是由DNA的动画短片段组成(约130-150bp),由癌细胞通过凋亡、坏死或腺体释放到循环系统里面。 ctDNA的半衰期较短致使其成为寻常的即时负载圣万,它的依赖于确实反映了具体方法上看不见的微分散。

在医治病态疗法结束后,ctDNA里面成现的体细胞等位基因突变对随后的具体方法中风不具极颇高的阳病态预测价值,特别是当这些等位基因突变与切除的的组织里面的等位基因突变相匹配时。探测这种ctDNA并不一定的MRD可以在I-III期CRC里面提从前具体方法数月预测中风,从而为一个大最终可能会中风的CRC症状包括一个检验另行疗法的窗口。然而,这些ctDNA制度化等位基因突变并不一定的MRD探测方法有的孔径仅仅是有限的,迫切均无需修改其探测病态能。

ctDNA的酪氨酸探测优于ctDNA的制度化等位基因突变探测。ctDNA的酪氨酸异故常在CRC里面非故常故近似于,并被视为大多数病因的年从前期阶段。这种酪氨酸,具体并不一定为DNA里面胞嘧啶的C5位置添加乙基基团,缓冲附近等位基因的隐含,最主要开端的抑癌等位基因失活。与制度化等位基因突变相比之下,CRC里面依赖于更加多的酪氨酸异故常区域,为提颇高MRD探测的孔径包括了机可能会。SEPT9,就是第一个利用血清探测单等位基因酪氨酸异故常展开筛查和年从前期探测CRC的方法有。尽管ctDNA酪氨酸有这些优点,但这些完全一致的特病态也均无需慎重,以保持良好探测归纳的特异病态,并尽量缩减假阳病态的确实病态。

在这种背景下,Parikh和Taieb的值得注意最另行研究课题结果为我们对ctDNA病态能的理解包括了感兴趣的补充,即无均需原发的组织,大部分通过血清ctDNA酪氨酸或联合ctDNA等位基因突变即可展开准确的MRD检验。与其他均无需对原发的组织展开核酸以范本年从前先ctDNA归纳的探测各不相同,值得注意研究课题探讨了Tumor-uninformed assays的有效病态,它有几个战术上,最主要迅速的TAT,降低初始费用,对的组织严重不足或不可用的症状展开风险评估。

Parikh等人包括了一种ctDNA酪氨酸联结ctDNA制度化等位基因突变的固定panel展开MRD的归纳检验(NGS方法有),与其他商业化上可用的MRD探测方法有相比之下,这种方法有不均无需切除的的组织以及定制化。在最终疗法后运用于时,这种大部分白蛋白ctDNA-MRD探测对中风不具诊断意义的特异病态(100%)和孔径(55.6%),通过整合密切之外线粒体形态和纵向风险评估归纳,其孔径可颇颇高至91%。1 该方法有被故近似于正要展开的从前瞻病态研究课题,最主要范本IIA期中风疗法执行者的NRG合作组研究课题(NCT04068103)。虽然还均无需额外的数据资料集来检验这些发现,但这些结果断言了基于ctDNA的MRD探测在不知情的情况下可给与的探测病态能形态。

Taieb等人的研究课题利用了一对先从前被断言是CRC切除后生存率之外的酪氨酸等位基因标记物WIF1和NPY(ddPCR方法有),并将它们应故近似于PRODIGE-GERCOR IDEA-France测试,将III期CRC症状随机分为3个月 vs 6个月的基本功能化疗。在对参加III期测试的III期CRC症状展开的首次ctDNA-MRD检验里面,有13.8%的症状术后为ctDNA-MRD阳病态,并被确认为独立的生存率圣万。3 同时,研究课题者也指成,与其他使用NGS方法有的ctDNA-MRD研究课题相比之下,本研究课题里面ctDNA的阳病态率颇高。孔径和PPV同样略低于NGS探测结果,ctDNA-MRD阳病态和阴病态的5年DFS分别为65%和73%,尽管基本功能疗法的和不理想的从前归纳比对处理确实可能会对这些结果转化成影响。该方法有值得注意的是其相对简单,非故常低的费用和潜在的复原病态,不均无需商业化探测里面所见的专利探测方法有。正要展开的从前瞻病态研究课题将进一步检验大部分白蛋白ctDNA探测是否能够准确检验MRD,以便对CRC症状展开风险分层,并范本基本功能疗法执行者。

无论使用何种方法有,大部分用白蛋白ctDNA-MRD探测来范本CRC症状的疗法不得不,均无需合理且准确的探测方法有。均需颇颇高大部分白蛋白ctDNA-MRD探测的孔径来明确哪些症状可以从疗法降入里面获益,以避免不恰当地选择颇高危症状给与颇高强度的疗法。Parikh及其同僚的研究课题结果表明,整合线粒体和密切之外线粒体以及纵向白蛋白风险评估,可显著提颇高大部分白蛋白ctDNA-MRD的孔径。相比之下之下,ctDNA-MRD探测的颇高特异病态对于ctDNA作为一个比较简单的生物圣万来明确疗法换用是至关重要的。由于特异病态严重不足,假阳病态的ctDNA-MRD确实可能会使症状给与可避免的强化疗法。Parikh及其同僚的研究课题结果断言,除制度化等位基因突变外,还可以通过联结密切之外线粒体酪氨酸形态的归纳来保持良好特异病态。Taieb等人的归纳方法有的战术上在于提颇高了诊断形态的孔径和生存率,但是,正如研究课题者否认的那样,单独的两个等位基因酪氨酸标记确实无法包括与联结制度化等位基因突变方法有的病态能形态。重要的是,这项工作也重申了新标准化归纳从前也就是说的重要病态,因为各种合成方法有可以在很大持续性上影响ctDNA的得率和比较简单病态。在未来的研究课题里面,这些归纳从前的考虑将变得越来越重要。

酪氨酸被纳入MRD探测的创造力是指明的,期盼这些进展将在此期间提颇高世代MRD探测的病态能。总之,大部分白蛋白ctDNA-MRD的探测包括了一个独特的机可能会,运用于一种无创方法有来探究疗法方案,并有确实根除颇高危症状的微分散病态结核。这些研究课题结果也许为未来ctDNA-MRD范本的从前瞻病态诊断测试铺平了沿路。

MRD,仅仅是一个迅速发展的应用,我们预计近两年确实可能会成现另行的确凿证据,要么辨识成MRD探测的诊断好处的局限病态,要么辨识成MRD探测的其他战术上和另行用途。

参考资料:

1.Parikh Aparna R,Van Seventer Emily E,Siregna Giulia et al. Minimal Residual Disease Detection using a Plasma-Only Circulating Tumor DNA Assay in Colorectal Cancer Patients.[J] .Clin Cancer Res, 2021, undefined: undefined.

2.Bent A, Kopetz S. Going with the Flow: The Promise of Plasma-Only Circulating Tumor DNA Assays. Clin Cancer Res. 2021 Oct 15;27(20):5449-5451.

3.Taieb Julien,Taly Valerie,Henriques Julie et al. Prognostic value and relation with adjuvant treatment duration of ctDNA in stage III colon cancer: a post-hoc ysis of the PRODIGE-GERCOR IDEA-France trial.[J] .Clin Cancer Res, 2021, undefined: undefined.

4.Benson Al B,Venook Alan P,Cederquist Lynette et al. Colon Cancer, Version 1.2017, NCCN Clinical Practice Guidelines in Oncology.[J] .J Natl Compr Canc Netw, 2017, 15: 370-398.

分享: